Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCFC2P16383 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCFC2P16383 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms