Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOLR1P15328 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOLR1P15328 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOLR1P15328 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms