Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS3P13797 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS3P13797 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS3P13797 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS3P13797 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS3P13797 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLS3P13797 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLS3P13797 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLS3P13797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLS3P13797 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLS3P13797 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLS3P13797 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLS3P13797 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLS3P13797 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLS3P13797 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLS3P13797 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLS3P13797 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLS3P13797 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLS3P13797 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLS3P13797 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLS3P13797 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLS3P13797 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLS3P13797 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLS3P13797 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms