Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2BP0DMP2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2BP0DMP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms