Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED1O96006 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED1O96006 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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