Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRATO95237 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRATO95237 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LRATO95237 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRATO95237 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRATO95237 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRATO95237 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRATO95237 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRATO95237 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRATO95237 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRATO95237 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRATO95237 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms