Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC22O60826 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms