Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYTH3O43739 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYTH3O43739 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYTH3O43739 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms