Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVH48-1M5A8F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVH48-1M5A8F1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms