Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
J3KT08 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KT08 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KT08 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KT08 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
J3KT08 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms