Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3KR12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3KR12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3KR12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3KR12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3KR12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3KR12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3KR12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3KR12 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3KR12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3KR12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3KR12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3KR12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3KR12 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3KR12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3KR12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3KR12 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3KR12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3KR12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3KR12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3KR12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3KR12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3KR12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3KR12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3KR12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3KR12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3KR12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
J3KR12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
J3KR12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3KR12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3KR12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms