Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
B4E1Z4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4E1Z4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4E1Z4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
B4E1Z4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
B4E1Z4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B4E1Z4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4E1Z4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
B4E1Z4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4E1Z4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B4E1Z4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
B4E1Z4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4E1Z4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
B4E1Z4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4E1Z4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4E1Z4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
B4E1Z4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
B4E1Z4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
B4E1Z4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
B4E1Z4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
B4E1Z4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
B4E1Z4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
B4E1Z4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
B4E1Z4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B4E1Z4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B4E1Z4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B4E1Z4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4E1Z4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4E1Z4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4E1Z4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4E1Z4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
B4E1Z4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
B4E1Z4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4E1Z4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4E1Z4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4E1Z4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4E1Z4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4E1Z4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4E1Z4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4E1Z4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4E1Z4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms