Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPD8

KDM4F, Lysine demethylase 4F, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4FA0A1W2PPD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM4FA0A1W2PPD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM4FA0A1W2PPD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms