Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms