Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIN3AQ96ST3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms