Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.044e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HDLBP-240ENST00000484412 669 ntTSL 513.34□□□□□ -0.279e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HDLBP-245ENST00000494862 356 ntTSL 211.3□□□□□ -0.69e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-205ENST00000467213 2782 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-210ENST00000622533 2937 ntTSL 512.71□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-208ENST00000488864 2415 ntTSL 212.64□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 DHCR24-202ENST00000436604 863 ntTSL 39.23□□□□□ -0.934e-55■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 19e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 GDI1-206ENST00000465640 754 ntTSL 1 (best)21.04■□□□□ 0.963e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 GRK2-207ENST00000529738 500 ntTSL 220.04■□□□□ 0.89e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 EFHD2-202ENST00000445566 899 ntTSL 518.72■□□□□ 0.599e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 PHF1-208ENST00000486845 1099 ntTSL 518.33■□□□□ 0.529e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.43■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 RAD23A-204ENST00000588329 1034 ntTSL 517.35■□□□□ 0.373e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ATG9A-215ENST00000446716 5245 ntTSL 217.34■□□□□ 0.379e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ABCB6-202ENST00000295750 2238 ntTSL 517.1■□□□□ 0.339e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ABCB6-205ENST00000448398 882 ntTSL 517.07■□□□□ 0.329e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ERCC2-202ENST00000391942 1488 ntTSL 216.47■□□□□ 0.239e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TBCB-203ENST00000468156 630 ntTSL 216.26■□□□□ 0.195e-16■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 RBMS1-214ENST00000491781 1533 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.159e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HAGLR-201ENST00000413969 545 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ABCB6-203ENST00000417678 793 ntTSL 515.84■□□□□ 0.139e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.127e-8■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.037e-8■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 PHF1-211ENST00000495509 1752 ntTSL 215.24■□□□□ 0.039e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 LSR-206ENST00000597446 478 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-17■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ABCB6-206ENST00000452545 544 ntTSL 415.06■□□□□ 09e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HAGLR-203ENST00000417086 984 ntTSL 214.59□□□□□ -0.072e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ABCB6-210ENST00000492953 570 ntTSL 414.41□□□□□ -0.19e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.119e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.129e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TBC1D24-206ENST00000569874 3061 ntTSL 514.24□□□□□ -0.139e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-13■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.29e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 GNA12-208ENST00000496740 2450 ntTSL 213.8□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 FBRSL1-203ENST00000537804 261 ntTSL 513.72□□□□□ -0.213e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TBC1D24-208ENST00000630263 4180 ntTSL 513.61□□□□□ -0.239e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.299e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HPX-204ENST00000527556 1126 ntTSL 213.19□□□□□ -0.39e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 MKNK1-202ENST00000342571 2422 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.39e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 FBRSL1-202ENST00000536075 208 ntTSL 513.1□□□□□ -0.313e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.329e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.339e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ZKSCAN1-204ENST00000482979 1449 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.359e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.359e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.379e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.419e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ZC3H4-204ENST00000597069 664 ntTSL 412.45□□□□□ -0.429e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-202ENST00000269138 1548 ntTSL 212.2□□□□□ -0.469e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-10■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 512.06□□□□□ -0.483e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-207ENST00000461764 1841 ntTSL 511.94□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.529e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 411.66□□□□□ -0.542e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 PCNX4-204ENST00000406949 3513 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-13■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HAGLR-205ENST00000436126 945 ntTSL 411.62□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-225ENST00000585121 1545 ntTSL 211.58□□□□□ -0.569e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HPX-211ENST00000534429 486 ntTSL 311.49□□□□□ -0.579e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SAP130-204ENST00000424298 849 ntTSL 211.35□□□□□ -0.599e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC11.07□□□□□ -0.649e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 LSR-208ENST00000599658 343 ntTSL 310.95□□□□□ -0.662e-17■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 510.8□□□□□ -0.682e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 GNA12-202ENST00000407653 3785 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.79e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 HPX-209ENST00000533561 429 ntTSL 510.6□□□□□ -0.719e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 DCAF8-213ENST00000477163 513 ntTSL 310.5□□□□□ -0.737e-8■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-213ENST00000579640 1840 ntTSL 210.44□□□□□ -0.749e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 GNA12-207ENST00000491117 3375 ntTSL 310.4□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC10.39□□□□□ -0.751e-10■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 AC008440.3-201ENST00000422045 555 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-217ENST00000580958 775 ntTSL 210.3□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 A1CF-208ENST00000414883 885 ntTSL 510.25□□□□□ -0.779e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 210.25□□□□□ -0.771e-10■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 C4BPB-204ENST00000391923 949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.89e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.849e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.869e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-21■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 FBRSL1-208ENST00000543453 205 ntTSL 39.6□□□□□ -0.873e-9■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 C4BPB-206ENST00000469326 1992 ntTSL 29.52□□□□□ -0.899e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 MTSS1-210ENST00000520771 3548 ntTSL 29.48□□□□□ -0.899e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-210ENST00000467309 1313 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.92e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.912e-21■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.922e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-202ENST00000373775 2199 ntTSL 59.2□□□□□ -0.942e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 SS18-220ENST00000582092 215 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.959e-6■□□□□ 8.7
PCBP2Q15366 C4BPB-202ENST00000367076 1113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.979e-6■□□□□ 8.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 606.2 ms