Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms