Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms