Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD247P20963 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD247P20963 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CD247P20963 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CD247P20963 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CD247P20963 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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