Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms