Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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