Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMBRD2Q68DH5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms