Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DSC2Q02487 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms