Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms