Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRP2BPQ9P2M1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRP2BPQ9P2M1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms