Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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