Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NUP62P37198 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NUP62P37198 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NUP62P37198 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms