Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF4P18085 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF4P18085 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF4P18085 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF4P18085 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF4P18085 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF4P18085 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms