Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKIP12755 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKIP12755 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIP12755 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms