Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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ZBED1O96006 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZBED1O96006 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZBED1O96006 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ZBED1O96006 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ZBED1O96006 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ZBED1O96006 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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