Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
XCL2Q9UBD3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms