Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms