Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf35-201ENST00000328376 1859 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL117378.1-201ENST00000454596 2305 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A7-202ENST00000397528 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A7-203ENST00000397529 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRE4P-201ENST00000597372 1810 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC004453.2-201ENST00000624861 2153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SERINC4-202ENST00000319327 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11L1-202ENST00000432887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms