Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TAF11Q15544 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms