Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRXP46100 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRXP46100 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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