Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms