Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms