Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CEP44Q9C0F1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms