Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms