Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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