Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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TSTA3Q13630 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TSTA3Q13630 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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