Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms