Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CASP1P29466 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP1P29466 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms