Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms