Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD3A2A2Y4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms