Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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