Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COG3Q96JB2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms