Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTL8BQ17RB0 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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