Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms