Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG7P83436 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG7P83436 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COG7P83436 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms